Tra giugno e luglio del 1966 il Brescia disputa la Coppa Piano Karl Rappan arrivando secondo nel proprio girone eliminatorio, mancando la qualificazione alla fase finale.
Ci sono volute ben dieci giornate per ottenere la prima vittoria in campionato: 3-2 al Venezia, decisiva una doppietta di Troja che segna le prime reti con le Rondinelle. Subito dopo questo successo, la squadra continua a risalire la classifica: arrivano il successo sul Napoli al Rigamonti e, dopo la sconfitta di Bologna, le vittorie con Lecco, dove D'Alessi con una doppietta segna la quinta rete in 5 partite, Lazio e Foggia, decisiva la rete di Troja all'89', tanto che il Brescia è ottavo in classifica con 16 punti in 15 giornate dopo 5 vittorie nelle ultime 6 gare. Le Rondinelle chiuderanno il girone d'andata all'undicesimo posto in classifica sempre con 16 punti.
Il girone di ritorno si apre con un rocambolesco 3-3 con la Roma dove gli uomini di Renato Gei erano sul 3-0 all'8' minuto, sarà un girone di ritorno complicato nonostante il pareggio raggiunto con la Juventus e la vittoria ai danni del Milan; le Rondinelle alla vigilia dell'ultima giornata si trovano al dodicesimo posto con 28 punti, con 1 punto sulla Lazio in zona retrocessione.
Nell'ultima giornata del torneo, fondamentale per i ragazzi di Renato Gei per ottenere la salvezza, fu la sconfitta della Lazio per 2-1 nella partita contro la Juventus, che rese nulla la sconfitta bresciana contro il Cagliari in casa (1-2 il risultato finale).
In questa stagione le rondinelle hanno subito una delle più pesanti sconfitte: ha perso infatti per 7-1 contro la Fiorentina al Comunale di Firenze.
Gaetano Troja risulta il miglior marcatore delle Rondinelle con 1 gol nella Coppa dell'Amicizia e 8 in Serie A (4 per girone), con un totale di 9 reti stagionali.
Le maglie utilizzate nella stagione furono quelle con disegno "classico", con la scelta di utilizzare il rosso per seconda e terza maglia (caratteristica delle maglie bresciane negli anni sessanta: la prima fu quella blu Savoia con V bianca, la seconda bianca con V rossa e la terza con colori invertiti rispetto a quest'ultima.
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