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Le specie animali endemiche dell'Italia censite fino ad ora sono rappresentate, per quanto riguarda il regno animale (quindi protozoi esclusi), da quasi 5 000 specie e si stima che rappresentino circa il 10% di quelle presenti in Italia. La percentuale è più alta tra gli invertebrati che tra i vertebrati (tra questi ultimi non supera il 3%) ed è più alta negli animali terrestri e d'acqua dolce (tra quelli marini è meno del 2%).
La percentuale è maggiore in Italia meridionale e in Sardegna, a causa del maggiore isolamento geografico. Fa eccezione la fauna ittica, tra la quale non vi è alcun endemismo sardo, mentre si annoverano numerose specie con areale limitato al bacino del Po o alle regioni che si affacciano sul mare Adriatico, soprattutto settentrionale.

Tra i vertebrati risultano endemici circa 80 taxa tra specie e sottospecie:

• Famiglia Petromyzontidae
  • Lampetra zanandreai Vladykov, 1955) (Endemica nei bacini fluviali dell'Adriatico settentrionale)

• Famiglia Acipenseridae
  • Acipenser naccarii Bonaparte, 1836 (Endemica nell'areale dell'Alto Adriatico)

• Famiglia Cyprinidae
  • Alburnus albidus (O. G. Costa, 1838) (Endemica in Abruzzo e Italia meridionale)
  • Alburnus arborella (Bonaparte, 1841) (Endemica del bacino dell'Adriatico: Italia settentrionale, ex Jugoslavia costiera e subcostiera e Albania)
  • Barbus caninus (Bonaparte, 1839) (Endemica nell'areale Padano-Veneto; introdotta in molti fiumi dell'Italia centrale)
  • Barbus plebejus (Bonaparte, 1839) (Endemica nell'areale Padano-Veneto)
  • Barbus tyberinus Bonaparte, 1839 (Endemica nei fiumi del versante tirrenico dell'Italia centrale, tra il Magra e il Sele; introdotta anche altrove; forse identico a B.plebejus)
  • Chondrostoma genei (Bonaparte, 1839) (Endemica nell'Italia settentrionale e nel versante adriatico degli Appennini; introdotta in Toscana, Liguria, Umbria e Lazio)
  • Chondrostoma soetta Bonaparte, 1840 (Endemica nell'areale Padano-Veneto, introdotta nell'Arno e in altri fiumi toscani a partire dagli anni ottanta)
  • Leucos aula (Bonaparte, 1841) (Endemica nell'areale Padano-Veneto, e nei fiumi tributari dell'alto Adriatico)
  • Sarmarutilus rubilio (Bonaparte, 1837) (Endemica in Italia centrale; introdotta in anni recenti in Romagna e in Sicilia)
  • Telestes muticellus (Bonaparte, 1837) (Endemica in Italia settentrionale e peninsulare fino a Campania e Molise)
  • Scardinius scardafa (Bonaparte, 1837) (Endemica del Lazio e del Lago Trasimeno, la validità della specie richiede conferma)
  • Squalius lucumonis (Bianco, 1983) (= Leuciscus lucumonis) (Endemica in Italia centrale, nell'Ombrone, nell'Arno superiore e in un tratto del Tevere)
• Famiglia Cobitidae
  • Cobitis bilineata Canestrini, 1865 (Endemica nell'Italia settentrionale e nelle Marche e in aree adriatiche limitate della Slovenia e della Croazia, forse una sottospecie di Cobitis taenia)
  • Cobitis conspersa Cantoni, 1882 (Endemica dell'Italia nordorientale; la validità della specie è dubbia, forse è sinonimo di Sabanejewia larvata)
  • Cobitis zanandreai Cavicchioli, 1965 (Endemica del bacino del Volturno e del Lago di Fondi)
  • Sabanejewia larvata (De Filippi, 1859) (Endemica nel bacino del Po; introdotta nel Lago Trasimeno e nei bacini di Tevere ed Ombrone)

• Famiglia Salmonidae
  • Salmo fibreni Zerunian & Gandolfi, 1989 (Endemica nel fiume Fibreno e nel Lago di Posta Fibreno in Lazio)
  • Salmo [trutta] marmoratus (Cuvier, 1817) (Endemica nell'areale Padano-Veneto e in Slovenia; le popolazioni sono spesso ibridate con la forma nominale)
  • Salmo cettii Rafinesque, 1810 (Italia centromeridionale, Sardegna, Sicilia e Corsica, poche popolazioni relitte, ibridata con la forma nominale).
  • Salmo carpio Linnaeus, 1758 (endemico del Lago di Garda)

• Famiglia Gobiidae
  • Knipowitschia panizzae (Verga, 1841) (Endemica delle regioni adriatiche italiane; introdotta sul versante tirrenico; nota anche del delta del fiume Evinos in Grecia)
  • Orsinigobius punctatissimus (Canestrini, 1864) (Endemica nell'Italia nordorientale)
  • Padogobius bonelli (Bonaparte, 1846) (Endemica nell'Italia settentrionale)
  • Neogobius nigricans (Canestrini, 1867) (Endemica nel versante tirrenico dell'Italia centrale)
  • Ninnigobius canestrinii (Ninni, 1883) (Endemica nelle acque costiere e salmastre del nord del bacino dell'Adriatico; una popolazione è stata introdotta anche in acque estuariali del Golfo di Taranto)
  • Pomatoschistus tortonesei (Miller, 1968) (Endemica di alcune lagune siciliane, presente anche in una stazione in Libia)

• Famiglia Salamandridae
  • Euproctus platycephalus (Gravenhorst, 1829) (Endemico della Sardegna)
  • Salamandra atra aurorae Trevisan, 1982 (Endemica dell'Altopiano di Asiago)
  • Salamandra lanzai Nascetti, Andreone, Capula & Bullini, 1988 (Endemica delle Alpi Cozie: Alta Valle del Po, Val Germanasca, Val Angrogna, Val Pellice e Val Chisone e del versante francese del Massiccio del Monviso)
  • Salamandra salamandra gigliolii Eiselt & Lanza, 1956 (Sottospecie endemica dell'Appennino e delle Alpi Marittime)
  • Salamandrina perspicillata (Savi, 1821) (Endemica degli Appennini a nord del fiume Volturno)
  • Salamandrina terdigitata (Lacépède, 1788) (Endemica dell'Appennino meridionale)
  • Triturus alpestris apuanus (Bonaparte, 1839) (Sottospecie endemica delle Alpi Marittime e dell'Appennino settentrionale e centrale)
  • Triturus alpestris inexpectatus Dubois & Breuil, 1983 (Sottospecie endemica della Calabria)
  • Lissotriton italicus (Peracca, 1898) (Endemico dell'Italia centrale e meridionale)
• Famiglia Plethodontidae
  • Speleomantes ambrosii (Lanza, 1955) (Endemico della Liguria orientale e nella Toscana nordoccidentale)
  • Speleomantes flavus (Stefani, 1969) (Endemico della Sardegna)
  • Speleomantes genei (Temminck & Schlegel, 1838) (Endemicao della Sardegna)
  • Speleomantes imperialis (Stefani, 1969) (Endemica in Sardegna)
  • Speleomantes italicus (Dunn, 1923) (Endemico dell'Appennino settentrionale e centrale)
  • Speleomantes strinatii (Aellen, 1958) (Endemico di una porzione della Francia sudorientale, delle Alpi liguri e Marittime e dell'Appennino settentrionale fino all'Emilia occidentale)
  • Speleomantes supramontis (Lanza, Nascetti & Bullini, 1986) (Endemico della Sardegna)

• Famiglia Alytidae
  • Discoglossus pictus pictus Otth, 1837 (Endemica in Sicilia)
  • Discoglossus sardus Tschudi, 1837 (Endemica nell'area tirrenica: Sardegna, Corsica, isole di Hyères, Arcipelago Toscano e Monte Argentario)
• Famiglia Bombinatoridae
  • Bombina pachypus (Bonaparte, 1838) (a sud del Po, lungo tutta la dorsale appenninica sino alla Calabria)
• Famiglia Pelobatidae
  • Pelobates fuscus insubricus Cornalia, 1873 (Endemica del bacino Padano-Veneto; sottospecie probabilmente non valida)
• Famiglia Hylidae
  • Hyla intermedia (Bouienger, 1882) (Endemica dell'Italia peninsulare e della Sicilia, a Nord Est fino al Trentino e al confine sloveno)
  • Hyla sarda (De Betta, 1853) (Endemica in Sardegna, Corsica e nell'Arcipelago Toscano)
• Famiglia Ranidae
  • Rana italica Dubois, 1987 (Endemica nell'Appennino)
  • Rana latastei Boulenger, 1879 (Endemica nella Pianura Padana, in limitate zone del Canton Ticino e della Slovenia confinanti con l'Italia, nonché in qualche stazione isolata dell'Istria)
• Famiglia Bufonidae
  • Bufotes boulengeri siculus Stöck et al., 2008 (Endemica della Sicilia)

• Famiglia Emydidae
  • Emys trinacris Fritz et al., 2005 (Endemica in Sicilia)

• Famiglia Lacertidae
  • Algyroides fitzingeri (Wiegmann, 1834) (Endemica in Corsica e in Sardegna)
  • Archaeolacerta bedriagae (Camerano, 1885) (Endemica in Corsica e in Sardegna)
    • Archaeolacerta bedriagae paessleri (Mertens, 1927) (Endemica in Sardegna)
    • Archaeolacerta bedriagae sardoa (Peracca, 1903) (Endemica in Sardegna)
  • Podarcis filfolensis (Bedriaga, 1876) (Endemica a Malta e nelle Isole Pelagie)
    • Podarcis filfolensis laurentiimuelleri (Fejérváry, 1924) (Endemica nelle Isole Pelagie)
  • Podarcis raffonei (Mertens, 1952) (Endemica delle Eolie)
  • Podarcis tiliguerta (Gmelin, 1789) (Endemica in Sardegna e in Corsica)
    • Podarcis tiliguerta ranzii (Lanza, 1967) (Endemica in Sardegna)
    • Podarcis tiliguerta toro (Mertens, 1932) (Endemica dell'Isola il Toro)
  • Podarcis waglerianus Gistel, 1868 (Endemica in Sicilia)
• Famiglia Scincidae
  • Chalcides chalcides chalcides (Linnaeus, 1758) (Endemica in Italia peninsulare, Sicilia ed Elba)
• Famiglia Colubridae
  • Zamenis lineatus (Suckow, 1798) (Endemica in Italia meridionale e in Sicilia)
  • Natrix natrix calabra (Vanni & Lanza, 1983) (Endemica in Calabria)
  • Natrix natrix cettii Gené, 1839 (Endemica in Sardegna)
  • Natrix natrix sicula (Cuvier, 1829) (Endemica in Sicilia)
• Famiglia Viperidae
  • Vipera ursinii ursinii (Bonaparte, 1835) (Endemica nell'Appennino abruzzese)
  • Vipera aspis francisciredi Laurenti, 1768 (Endemica in Italia centro-settentrionale)
  • Vipera aspis hugyi Schinz, 1833 (Endemica in Italia meridionale e Sicilia)
  • Vipera walser Ghielmi, Menegon, Marsden, Laddaga & Ursenbacher, 2016 (Endemica nelle Alpi Occidentali)

• Famiglia Accipitridae
  • Accipiter gentilis arrigonii, Kleinschmidt, 1903 (Endemica della Sardegna e della Corsica)
  • Accipiter nisus wolterstorffi, Kleinschmidt, 1901 (Endemica della Sardegna e della Corsica)
  • Buteo buteo arrigonii (Endemica della Sardegna e della Corsica)

• Famiglia Passeridae
  • Passer italiae

• Famiglia Soricidae
  • Sorex samniticus Altobello, 1926 (Endemica nell'Italia peninsulare)
  • Crocidura ichnusae Festa, 1912 (Endemica in Sardegna)
  • Crocidura russula cossyrensis Contoli, 1989 (Endemica dell'Isola di Pantelleria)
  • Crocidura sicula Miller, 1901 (Endemica in Sicilia e nelle Isole Maltesi)
• Famiglia Talpidae
  • Talpa romana Thomas, 1902 (Endemica in Italia centrale e meridionale)

• Famiglia Vespertilionidae
  • Plecotus sardus Mucedda, Kiefer, Pidinchedda & Veith, 2002 (Endemica in Sardegna)

• Famiglia Leporidae
  • Lepus corsicanus de Winton, 1898 (Endemica della Sicilia e dell'Italia peninsulare; introdotta in Corsica)
  • Lepus capensis mediterraneus Wagner, 1758 (Endemica della Sardegna)

• Famiglia Gliridae
  • Eliomys quercinus liparensis Kahmamm, 1960 (Endemica dell'isola di Lipari)
  • Eliomys quercinus sardus Barrett-Hamilton, 1901 (Endemica in Sardegna)
• Famiglia Microtidae
  • Microtus savii de Sélys Longchamps, 1838) (Endemica dell'Italia e della Sicilia, marginalmente anche in Francia sudorientale e Svizzera meridionale)
• Famiglia Sciuridae
  • Sciurus meridionalis Lucifero, 1907 (Endemica di Calabria e Basilicata)

• Famiglia Canidae
  • Canis lupus italicus (Altobello, 1921) (Endemica dell'Appennino, con areale esteso alle Alpi Occidentali e alla Svizzera meridionale)
  • Vulpes vulpes ichnusae Miller, 1907 (Endemica della Sardegna e della Corsica)
• Famiglia Ursidae
  • Ursus arctos marsicanus Altobello, 1921 (Endemica dell'Appennino centrale)

• Famiglia Suidae
  • Sus scrofa meridionalis Forsyth Major, 1882 (Endemica in Sardegna e Corsica)
• Famiglia Cervidae
  • Cervus elaphus corsicanus Erxleben, 1777 (Endemica in Sardegna e Corsica)
  • Capreolus capreolus italicus Festa, 1925 (Endemica, con popolazioni relitte nella Tenuta presidenziale di Castelporziano in Lazio, nella Foresta Umbra in Puglia, nei Monti di Orsomarso in Calabria e in Maremma tra Toscana meridionale e Lazio settentrionale)
• Famiglia Bovidae
  • Ovis orientalis musimon Pallas, 1811) (Endemica in Sardegna; introdotta in Italia peninsulare e in Sicilia)
  • Capra ibex ibex Linnaeus, 1758 (Endemica delle Alpi, sopravvissuta nel Gran Paradiso e successivamente reintrodotta altrove)
  • Rupicapra pyrenaica ornata Neumann, 1899 (Endemica dell'Appennino centrale)

• Amori G., Contoli L. & Dupré E. – Mammiferi Insettivori https://web.archive.org/web/20081203000233/http://www2.minambiente.it/sito/settori_azione/scn/docs/qcn/mi/qcn_mammiferi_insettivori.pdf (visitato 3/12/2007)
• European Commission - European Mammal Assessment http://ec.europa.eu/environment/nature/conservation/species/ema/index.htm
• Ministero dell'Ambiente - Guida alla Fauna d'interesse comunitario http://www.minambiente.it/index.php?id_sezione=2083&sid=115b7577119fdbded6132c0e323d6f58 (visitato 3/12/2007)
• Museo civico di Storia Naturale di Ferrara - Atlante on-line degli Anfibi e Rettili dell'Emilia Romagna https://web.archive.org/web/20071025051808/http://ww2.comune.fe.it/storianaturale/index.phtml?id=130 (visitato 3/12/2007)
• Porcellotti S. e Associazione ICHTHYOS - Web Museo della Fauna Europea http://www.ittiofauna.org/webmuseum/indexwm.htm (visitato 3/12/2007)
• Stoch F. (eds.), 2000-2003 - Checklist delle specie della fauna italiana. On-line version 2.0, http://www.faunaitalia.it/checklist/ Checklist della fauna italiana (Last update: December 3, 2003)

• Biodiversità in Italia
• Endemismo
• Farfalle e falene endemiche dell'Italia
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• Lista di fauna della Sardegna

• Immagini di rettili e anfibi endemici, su herp.it.

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