Barton fu scelto dai San Francisco 49ers nel primo giro del draft 1987 come 22º assoluto[1]. Fu il primo uomo della linea offensiva scelto dai San Francisco 49ers nel primo giro dai tempi di Forest Blue nel 1968. Nella sua prima stagione giunse secondo nel premio di rookie dell'anno.
Coi Niners vinse tre Super Bowl, nel 1988, 1989 e 1994[2]. Partì come titolare in 134 delle 138 gare disputate in carriera e si ritirò dopo la stagione 1998.
^(EN) 1987 National Football League Draft, Pro Football Hall of Fame. URL consultato il 7 marzo 2013 (archiviato dall'url originale il 14 ottobre 2013).