Voce principale: Bones (serie televisiva).

L'undicesima stagione della serie televisiva Bones è stata trasmessa in prima visione assoluta negli Stati Uniti d'America da Fox dal 1º ottobre 2015 al 21 luglio 2016. Il quinto episodio della stagione costituisce la prima parte di un crossover con la serie Sleepy Hollow e si conclude nel quinto episodio della terza stagione di quest'ultima.

In Italia la stagione è stata trasmessa in prima visione assoluta su TOP Crime dal 22 settembre al 1º dicembre 2016.

• Titolo originale: The Loyalty in the Lie
• Diretto da: Randy Zisk
• Scritto da: Jonathan Collier

Sono passati sei mesi da quando Booth e Brennan hanno lasciato i rispettivi lavori all'FBI e al Jeffersonian. Brennan ha dato alla luce il suo secondo bambino, chiamato Hank come il nonno di Booth, e ha scritto un nuovo romanzo, mentre Booth ora addestra le reclute dell'FBI. La squadra del Jeffersonian viene chiamata per un corpo bruciato all'interno di un furgone e inizialmente si pensa che si tratti di Booth quando la sua pistola viene trovata sulla scena e dopo aver esaminato i resti, che presentano segni di abusi infantili. Brennan, molto preoccupata, si precipita al Jeffersonian per occuparsi personalmente del riesame e scopre che il corpo non è di Booth. Inoltre manifesta il suo disappunto per la gestione del laboratorio in sua assenza (infatti il suo posto era stato preso da Arastoo e la percentuale di casi irrisolti è aumentata). L'agente Aubrey è costretto a lavorare con l'agente Grace Miller delle Indagini Interne che respinge l'idea della scomparsa di Booth e lo aggiunge alla lista dei sospetti per l'omicidio. Brennan conclude che il corpo è di Jared Booth, il fratello di Seeley. Aubrey e Miller fanno visita a Kevin O'Donnell, un caro amico di Jared, ma non collabora. Il team scopre che Booth e altri quattro stavano rintracciando un signore della droga. L'FBI perquisisce la casa di quest'ultimo e trova tre uomini morti nell'ufficio principale e la cassaforte vuota. Arastoo ha comprato un anello per fare la proposta di matrimonio a Cam, ma vengono interrotti da Hodgins. Successivamente Angela conferma che Booth era presente sulla scena poiché molto del suo sangue è stato rinvenuto lì. Caroline scopre che l'agente Miller ha nascosto che anche il suo partner è scomparso e consiglia ad Aubrey di indagare. Booth cauterizza le proprie ferite e viene rivelato che sta lavorando con Kevin e gli altri e che hanno rubato i soldi dalla cassaforte per poterli scambiare.

• Note.
  • David Boreanaz, l'interprete di Seeley Booth, si era ammalato finendo in ospedale, perciò gli sceneggiatori si sono dovuti inventare la storyline della scomparsa del personaggio per permettergli di guarire completamente.
  • La combinazione della cassaforte di Booth è 447, un numero ricorrente nel corso dell'intera serie e apparso, ad esempio, nel duecentesimo episodio, il cui significato verrà spiegato solo nell'ultimo episodio della serie.

• Ascolti USA: telespettatori 6 200 000^[1]

• Titolo originale: The Brother in the Basement
• Diretto da: Dwight Little
• Scritto da: Michael Peterson

In un flashback si vedono Booth, Kevin e gli altri distruggere le prove e bruciare il furgone con il corpo di Jared all'interno. Booth insiste che deve essere lui a farlo. Nel presente, l'agente Miller ammette ad Aubrey e Caroline che il suo partner scomparso Richard aveva un elenco stampato di agenti sotto copertura dell'FBI. La squadra rinviene un dito mozzato della fidanzata di Richard, Chloe, che era trattenuta in cambio del riscatto per la lista, nel suo congelatore. Dopo aver recuperato le prove, la squadra scopre i corpi di Richard e Chloe. Al Jeffersonian arriva il dottor Benjamin Metzger, un analista forense digitale dell'FBI, per aiutare Angela. Tuttavia, le prove indicano che è stato proprio quest'ultimo a uccidere Richard e Chloe per ottenere l'elenco. Brennan si fa rivelare da Metzger la posizione di Booth. Nel magazzino in cui è nascosto, Booth continua a curare le proprie ferite mentre gli altri aspettano di vendere la lista per 4 milioni di dollari. Kevin riceve un messaggio da Metzger che dice che Booth è dell'FBI e che deve ucciderlo o l'affare salta; Kevin non vuole uccidere Booth, ma poi scoppia una colluttazione e Kevin viene ucciso. La squadra SWAT irrompe e Booth si riunisce con Brennan, scusandosi per non averle detto la verità. In ospedale, dopo aver subito un intervento, Brennan gli comunica che riprenderà il suo posto al Jeffersonian e gli dice che anche lui dovrebbe tornare all'FBI perché salvare vite è ciò che lui ha sempre voluto fare. Nel frattempo, Arastoo lascia Cam perché vuole andare avanti e non restare un tirocinante per sempre, perciò ha intenzione di cercare un altro impiego come capo antropologo forense altrove, e rimanere con lei significherebbe che dovrebbe seguirlo ovunque lo prenderanno e non vuole che lei ce l'abbia con lui per questo.

• Ascolti USA: telespettatori 5 900 000^[2]

• Titolo originale: The Donor in the Drink
• Diretto da: Michael Lange
• Scritto da: Hilary Weisman Graham

Booth e Brennan tornano ai rispettivi lavori all'FBI e al Jeffersonian; indagano sulla morte di un uomo, identificato come Lloyd Nesbit, un inventore miliardario, trovato in un allevamento ittico e i cui organi sono stati asportati e venduti al mercato nero. Booth cerca di riadattarsi, anche se scopre che il suo ufficio è stato occupato da Aubrey, ed è frustrato poiché le ceneri di suo fratello sembrano scomparse. Nel frattempo, Hodgins incoraggia Angela a esporre le sue fotografie, e organizza una mostra al "Founding Fathers" a cui si presenta anche Sebastian Kohl, noto giornalista/fotografo che, ammirato, le consiglia di continuare a sviluppare il suo talento. Le indagini stabiliscono che a uccidere l'uomo con un pezzo di auto è stato il suo collaboratore, il quale ha anche venduto i suoi organi al mercato nero. Alla fine dell'episodio, Booth scopre che è stata la figlia a prendere la scatola contenente le ceneri di Jared, per usarla come scaletta per riuscire a entrare nella culla del fratellino.

• Ascolti USA: telespettatori 5 790 000^[3]

• Titolo originale: The Carpals in the Coy-Wolves
• Diretto da: Randy Zisk
• Scritto da: Gene Hong

Un padre e un figlio a caccia scoprono un corpo smembrato e distrutto dai coyote in un bosco. La vittima era un agente immobiliare, ma anche un campione di "fanta football" americano, alle cui competizioni sembrano essere collegati molti sospettati. L'assassino si rivelerà essere l'amministratore di tali competizioni. Brennan chiede aiuto all'antropologa forense Beth Mayer, che fornisce diversi contributi al caso. Nel frattempo, Booth è infastidito dal fatto che la moglie abbia ucciso nel suo ultimo romanzo il suo alter ego letterario, l'Agente Speciale Andy Lister; il tirocinante Oliver Wells confida a Hodgins di soffrire di disfunzione erettile.

• Altri interpreti: Betty White (dott.ssa Beth Mayer)
• Ascolti USA: telespettatori 6 060 000^[4]

• Titolo originale: The Resurrection in the Remains
• Diretto da: Chad Lowe
• Scritto da: Mary Trahan

Ad Halloween il team del Jeffersonian trova in una chiesa abbandonata il cadavere di una ragazza, una studentessa di medicina, sotto le assi del pavimento, e accanto a lei la tomba vecchia di 200 anni con il simbolo di una runa nordica inciso sopra; il simbolo raffigura un comandante delle forze britanniche della Guerra d'Indipendenza a cui manca la testa. Alla notizia della doppia scoperta, arrivano da Westchester l'Agente dell'FBI Abbie Mills e Ichabod Crane. Una volta ritrovata la testa mancante, gli esami rivelano che è lo strumento utilizzato dal fidanzato della ragazza per ucciderla.

• Altri interpreti: Nicole Beharie (Abbie Mills), Tom Mison (Ichabod Crane)
• Note. L'indagine si conclude nell'episodio intitolato Gli zombie non parlano della terza stagione di Sleepy Hollow che vede la partecipazione, in qualità di special guest stars, di Emily Deschanel (Temperance Brennan) e David Boreanaz (Seeley Booth).

• Ascolti USA: telespettatori 6 570 000^[5]

• Titolo originale: The Senator in the Street Sweeper
• Diretto da: Steve Robin
• Scritto da: Emily Silver

Nella spazzatura viene trovato il corpo di un Senatore; il caso conduce Booth e Brennan fino a Capitol Hill. Tra i sospettati ci sono la moglie della vittima e il capogruppo di maggioranza. L'assassino si rivelerà essere l'assistente del Senatore, che era anche l'amante della moglie. Caroline fa eseguire ad Aubrey un controllo sui precedenti della tirocinante Jessica Warren, da cui viene fuori che all'università lei si era unita a Greenpeace ed era stata coinvolta nell'esplosione di un ordigno durante una protesta. Dopo qualche tentennamento lui accetta il suo passato perché l'ha resa la persona che è oggi, e alla fine la porta a cena fuori: sembra che tra i due stia nascendo più di un'amicizia. Inoltre, Aubrey informa Booth delle sue ambizioni politiche in futuro.

• Ascolti USA: telespettatori 5 340 000^[6]

• Titolo originale: The Promise in the Palace
• Diretto da: Jeannot Szwarc
• Scritto da: Joe Hortua

Alcuni ciclisti trovano nei boschi il corpo di una vittima, che si scopre essere una prestigiatrice. Booth e Brennan indagano al Magic Palace, il luogo in cui lavorava la vittima e vari sospetti riconducono all'interno della comunità di prestigiatori. Nel frattempo, Sebastian Kohl torna a lavorare con Angela sulla sua fotografia e in seguito chiede a Cam di uscire, ma lei non è sicura di essere pronta per una relazione dopo la sua rottura con Arastoo. Si scopre che l'assassino è proprio il proprietario del Magic Palace che aveva presa sotto la sua ala la vittima, ma quando aveva scoperto che la donna se ne voleva andare, aveva perso la testa strangolandola con un lucchetto. Alla fine Cam cerca di andare avanti accettando l'invito di Sebastian.

• Ascolti USA: telespettatori 5 160 000^[7]

• Titolo originale: High Treason in the Holiday Season
• Diretto da: Anne Renton
• Scritto da: Jon Cowan

Il team indaga sulla morte di una giornalista politica, trovata in un laghetto di un campo da golf, che aveva pubblicato documenti che denunciavano la corruzione nell'NSA. A collaborare alle indagini arriva un Agente dell'agenzia che si rivela essere sia la fonte della giornalista sia il suo assassino, venendo anche arrestato per tradimento. Nel frattempo, il primo figlio di Booth, Parker, torna da Londra chiamato da Brennan per fare una sorpresa al marito, e il gruppo del Jeffersonian festeggia insieme il Ringraziamento. Angela rivela a Brennan il suo desiderio di avere un altro bambino.

• Ascolti USA: telespettatori 5 250 000^[8]

• Titolo originale: The Cowboy in the Contest
• Diretto da: Chad Lowe
• Scritto da: Karine Rosenthal

Un corpo viene portato al Jeffersonian e dall'aspetto sembra si tratti di un cowboy ma in realtà è un ragioniere che partecipava a gare di tiro al bersaglio con fucili d'epoca e costumi da cowboy. Booth e Brennan vanno sotto copertura nei panni di Buck e Wanda in una di queste gare in stile Vecchio West, competendo uno contro l'altra mentre cercano di scovare l'assassino; è proprio in questo ambiente che l'uomo è stato ucciso dall'amante del proprietario che aveva minacciato di dire tutto alla moglie. Nel frattempo, Cam continua la sua relazione con Sebastian e Hodgins confessa ad Angela che non è pronto per altri figli essendo appagato dalla famiglia che ha.

• Ascolti USA: telespettatori 4 630 000^[9]

• Titolo originale: The Doom in the Boom
• Diretto da: Michael Lange
• Scritto da: Keith Foglesong

Un corpo viene trovato in un parcheggio; quando Cam, Hodgins e Aubrey vanno sulla scena per esaminarlo si accorgono che all'interno c'è una bomba che esplode uccidendo diversi poliziotti: Cam si salva perché lontana dal corpo e Hodgins viene protetto da Aubrey che riporta gravi ferite. Mentre Hodgins sembra guarire rapidamente, Aubrey è in condizioni più critiche e necessita di un intervento chirurgico. Al Jeffersonian arriva Arastoo accorso per accertarsi delle condizioni di Cam e per dare una mano; si scopre che anche l'uomo - bomba era un poliziotto. Booth viene affiancato dalla stravagante analista comportamentale Karen Delfs per elaborare il profilo del possibile colpevole. Alla fine si risale a due ragazzi, uno dei quali aveva il padre poliziotto che beveva e lo picchiava. Dopo aver risolto il caso, Arastoo confessa a Cam che la ama ancora e che andarsene è stato un errore, ma lei gli dice che al momento sta frequentando una persona. Il loro leggero imbarazzo è interrotto dall'urlo terrorizzato di Angela: Hodgins è svenuto all'improvviso. All'ospedale, la squadra viene informata che Hodgins è paralizzato dalla vita in giù a causa del trauma subito dall'esplosione della bomba.

• Ascolti USA: telespettatori 4 420 000^[9]

• Titolo originale: The Death in the Defense
• Diretto da: Arlene Sanford
• Scritto da: Kendall Sand

Otto settimane dopo l'esplosione della bomba, Hodgins torna al Jeffersonian su una sedia a rotelle, desideroso di rientrare al lavoro, ma si rende conto di doversi adattare a un ambiente non attrezzato per un disabile e si sente impotente e frustrato. Malgrado le sue elevate capacità, che lo rendono una risorsa preziosa, Cam decide di rimandarlo a casa in modo che il suo lavoro non interferisca con la sua guarigione. Tuttavia, in seguito riconsidera la sua decisione e lo lascia tornare perché capisce che ha bisogno di uno scopo. Quella sera, lui riceve una chiamata dalla sua dottoressa che gli dice che non camminerà mai più poiché non c'è connettività neurale e lo nasconde ad Angela. Brennan e Booth indagano sulla morte di un difensore pubblico che aveva molti clienti con un buon motivo per ucciderla, e Brennan si preoccupa per Hodgins.

• Ascolti USA: telespettatori 4 400 000^[10]

• Titolo originale: The Murder of the Meninist
• Diretto da: Ian Toynton
• Scritto da: Hilary Weisman Graham

All'interno di una macchina viene rinvenuto il corpo bruciato di un uomo: all'inizio si pensa che sia stato un incidente ma più tardi si scopre che è stato prima ucciso e poi messo nella macchina. I sospetti si indirizzano verso l'associazione sessista per i diritti degli uomini fondata dalla vittima. Nel corso dell'interrogatorio del co-fondatore dell'organizzazione, Brennan gli dà un pugno dopo che lui ha espresso commenti misogini nei suoi confronti. A uccidere la vittima è stata l'ex moglie per poter avere il mantenimento, con la complicità del suo amante. Nel frattempo, l'atteggiamento freddo, rancoroso e sarcastico di Hodgins provocato dalla sua paralisi mette a dura prova sia l'ambiente in laboratorio che il suo rapporto con Angela, che è costretta a subirlo in prima persona e fa del suo meglio per stargli accanto. Booth crede che Brennan attiri la sfortuna nelle partite dei Philadelphia Flyers.

• Ascolti USA: telespettatori 4 380 000^[11]

• Titolo originale: The Monster in the Closet
• Diretto da: Randy Zisk
• Scritto da: Michael Peterson

Il cadavere di un'assistente sociale trovato in un parco per famiglie presenta indizi che suggeriscono che l'assassino abbia vissuto con esso per almeno sei mesi prima di abbandonarlo; inoltre, indossa un abito e ha accessori vintage, quindi l'assassino l'ha anche "travestito", e le ossa mostrano fori di trapano in alcuni punti. Mentre Booth e Aubrey consultano l'analista comportamentale Karen Delfs, Arastoo, assunto da Brennan come consulente esterno, spiega a quest'ultima che i segni sullo scheletro sono gli stessi di quelli su un gruppo di ossa non identificate conservate nel Limbo e da lui stesso catalogate nel periodo di congedo di Brennan. Ciò fa dedurre che si tratta di un serial killer che usa i cadaveri come marionette. Cam prova sentimenti contrastanti per la presenza di Arastoo, ma ammette con Angela che è bello averlo attorno, avendo deciso di lasciare Sebastian. Angela è esausta e frustrata per il comportamento di Hodgins: ormai litigano molto spesso e non riescono più a comunicare. Brennan si dà la colpa per essere andata in congedo tempo prima, perché se fosse rimasta forse il killer non avrebbe continuato a uccidere; lei e Booth sono anche impegnati sul fronte domestico, in quanto la figlia Christine ha incubi notturni su un presunto mostro nell'armadio. L'episodio si chiude con un'inquadratura su un uomo incappucciato che sta visionando al computer le riprese della telecamera nascosta a casa di uno dei sospettati, in cui i membri del Jeffersonian si erano recati alla ricerca di prove.

• Ascolti USA: telespettatori 4 380 000^[12]

• Titolo originale: The Last Shot at a Second Chance
• Diretto da: David Grossman
• Scritto da: Emily Silver

Aubrey e Jessica tentano di baciarsi ma finiscono per darsi una testata. Al Jeffersonian arriva il cadavere di una donna trovata sommersa dal fango, è un'ex detenuta che frequentava un centro di riabilitazione per tossicodipendenti. Uno dei sospettati è un ragazzo conosciuto da Booth in prigione. L'assassino si rivelerà essere il gestore del centro. Brennan compare davanti a una Commissione dell'FBI per aver aggredito con un pugno un sospettato (nell'episodio "Superstizioni sessiste") e riceve sei mesi di libertà vigilata sotto la supervisione di Booth. Hodgins è nella fase in cui ignora Angela e lei sente che la sta allontanando, riconoscendo che non è più l'uomo di cui si è innamorata, e fa un sogno spinto su Sebastian. Hodgins si rende conto del modo in cui l'ha trattata recentemente e, credendo di non meritarsela, le chiede il divorzio cedendole anche tutti i suoi beni, ma lei si rifiuta dicendo che questa è una scelta da vigliacchi e che la vita è dura ma le cose si superano insieme, allora si riappacificano. Mentre mangiano un gelato per strada, Aubrey e Jessica parlano del fatto che entrambi vorrebbero fare un passo avanti nella loro relazione, ma finora hanno avuto paura e non è mai arrivato il momento giusto; a un certo punto lei rischia di essere investita da un'auto, lui la salva gettandola a terra di lato e finalmente, sul marciapiede, si baciano.

• Ascolti USA: telespettatori 4 290 000^[13]

• Titolo originale: The Fight in the Fixer
• Diretto da: Silver Tree
• Scritto da: Joe Hortua

Dopo che dal Potomac viene ripescato un cadavere completamente ricoperto di ghiaccio, il team scopre che la vittima era sia un investigatore privato che un "risolutore di problemi" (infatti aiutava le persone ricattate); ciò rende molto più ampio il bacino dei sospettati. Al laboratorio l'atmosfera è più distesa poiché Hodgins sta finalmente tornando quello di prima, allegro, curioso e disponibile, e per farsi perdonare il suo recente comportamento verso Angela le regala dei gioielli. Quest'ultima, pur apprezzando i suoi gesti, pensa tuttavia che il marito si stia sforzando troppo, e di comune accordo cedono i monili a Cam. Aubrey è colto alla sprovvista da un invito a uscire da parte di Karen Delfs, la quale gli comunica che sarà trasferita a Kansas City. Brennan e Booth commentano orgogliosi la pagella di Christine, e successivamente Brennan fa una scommessa con il tirocinante Oliver Wells dopo che quest'ultimo le insinua il dubbio che la figlia possa aver barato nel voto di arte, e Hodgins viene incaricato di effettuare dei test per averne la certezza scientifica. Alla fine dell'episodio, Aubrey legge il file riguardante suo padre (fuggito all'estero anni prima dopo aver truffato molti clienti con uno schema Ponzi) scoprendo che è tornato negli Stati Uniti e lo sta cercando.

• Ascolti USA: telespettatori 4 260 000^[14]

• Titolo originale: The Strike in the Chord
• Diretto da: Michael Lange
• Scritto da: Yael Zinkow

Due ragazzi entrati in un laboratorio di un college per liberare dei topi impiegati come cavie trovano il corpo di uno studente di quella stessa scuola che faceva parte di un gruppo a cappella. Booth cerca dei sospettati proprio nei due gruppi di coro rivali, maschile e femminile. L'assassino si rivelerà essere il compagno di stanza della vittima, perché quest'ultimo aveva preso i suoi ansiolitici. Gli "squints" del Jeffersonian accolgono Sammy Mills, una tirocinante proveniente dal programma di scambio del museo parecchio entusiasta di essere stata scelta, ma che si dimostra imprecisa, affrettata e imbranata, e il suo lavoro approssimativo; ciò irrita la Brennan, la quale, a causa della sua incompetenza che le fa commettere numerosi errori e rallenta le indagini, successivamente la rimuove dal caso. Hodgins prende in considerazione di sottoporsi a un'operazione chirurgica sulla rigenerazione neurale per riavere l'uso delle gambe; Angela gli dice che non le sembra una buona idea e che prima dovrebbero valutare insieme i rischi, ma lui replica che è lui a dover decidere. Booth progetta per l'estate una gita sul sentiero degli Appalachi insieme al figlio Parker (che vive a Londra con la madre), ma è dispiaciuto quando scopre che lui vorrebbe partecipare a un corso di scrittura creativa a Oxford che si tiene nello stesso periodo; grazie all'intermediazione di Bones, capirà che il corso è l'occasione per il figlio di sviluppare il suo talento di scrittore. Alla fine, il passato di Aubrey da cantante a cappella al college viene alla luce, e riuniti a casa di Booth e Brennan tutti guardano il vecchio video di una sua esibizione durante una gara, prendendolo in giro.

• Ascolti USA: telespettatori 4 290 000^[15]

• Titolo originale: The Secret in the Service
• Diretto da: Dwight Little
• Scritto da: Kandall Sand e Mary Trahan

Un ubriaco nel bosco si imbatte nel cadavere di un agente dei Servizi Segreti, e sono proprio questi ultimi ad arrivare al Jeffersonian per condurre le indagini. Con loro c'è Colin Fisher, un ex tirocinante di Brennan che nel frattempo ha conseguito il dottorato, mandato in qualità di antropologo forense per sostituire Brennan, a casa malata. L'omicidio dell'agente porta a chiedersi se sia stato personale o un tentativo di colpire il Presidente. Aubrey lavora con una collega della vittima dopo che i Servizi Segreti impediscono il coinvolgimento di Booth a causa del suo antenato John Wilkes Booth (l'assassino di Abramo Lincoln), ma poi la sua posizione viene chiarita. Il Presidente è in pericolo e Booth sospetta che sia uno dei suoi agenti ad aver ucciso la vittima, quindi entra a far parte della scorta per scoprire chi lo vuole uccidere. All'arrivo del Presidente un sospettato che era stato scagionato tenta di sparargli ma a essere ferito a morte è il capo della sicurezza. L'autopsia eseguita da Cam rivela che in realtà è stato lui a uccidere il suo agente perché, per un grave danno, il sangue gli era finito nel cervello causandogli perdite di memoria. Hodgins cerca di estorcere a Fisher i dettagli dell'incarico in cui è stato impegnato durante l'assenza dal Jeffersonian, ma lui rifiuta di parlarne dicendo che sono informazioni riservate; alla fine dell'episodio Angela dichiara di averlo scoperto: Colin era il tutor scolastico nientemeno che della figlia del Presidente, e ha vissuto alla Casa Bianca.

• Ascolti USA: telespettatori 4 630 000^[16]

• Titolo originale: The Movie in the Making
• Diretto da: Randy Zisk
• Scritto da: Keith Foglesong

Una troupe televisiva che vuole realizzare un servizio - documentario sulla sezione medico-legale del Jeffersonian segue passo per passo la squadra mentre indaga sul ritrovamento, in una discarica, di un cadavere seppellito lì dieci anni prima. L'assassino si rivelerà essere il suo amico e socio, che l'ha ucciso per una faccenda di soldi. Le telecamere riprendono i protagonisti anche dietro le quinte, offrendo commenti, rivelazioni e ricordi sinceri (ad esempio, Hodgins menziona Zack Addy, primo tirocinante della Brennan apparso nelle prime due stagioni e rinchiuso in una clinica psichiatrica; in una scena Arastoo mostra la targa commemorativa di Vincent Nigel - Murray, altro tirocinante ucciso da un cecchino seriale nel finale della sesta stagione; Angela riassume la vicenda della paralisi del marito, mentre Brennan e Booth ricordano Sweets). Inoltre, Bones partecipa al "Giorno della Carriera" nella classe della figlia, convincendosi che Christine sia portata per l'Antropologia Forense; rimarrà sorpresa quando la piccola esprimerà la sua intenzione di diventare una venditrice di auto. Arastoo cerca di nascondere i propri sentimenti verso Cam alle telecamere, ma poi lei gli sente dire che desidera essere un marito e un padre, gli confessa di amarlo, gli chiede di sposarla, e lui accetta.

• Ascolti USA: telespettatori 4 610 000^[17]

• Titolo originale: The Head in the Abutment
• Diretto da: Ian Toynton
• Scritto da: Gene Hong

Il cadavere decapitato di un popolare giocatore di hockey su ghiaccio professionista viene trovato nel fiume Anacostia; Booth, che da giovane ha praticato questo sport e ne è un grande appassionato, lavora al caso con grande entusiasmo, e la sua profonda conoscenza di esso risulta fondamentale. Si scoprirà che l'assassino è un altro giocatore, il quale, avendo messo incinta una spacciatrice, voleva proteggere quest'ultima dalla vittima che voleva denunciarla. Hodgins e il dottor Wells diventano competitivi l'uno verso l'altro dopo che Oliver batte il collega a un videogame, e come rivincita fanno a gara a chi individua per primo la testa della vittima pilotando da remoto due droni costruiti da Hodgins. A casa, Brennan e Booth sono alle prese con le pulizie di primavera, ma hanno qualche difficoltà a liberarsi delle proprie cose; Cam mostra a Brennan e Angela l'anello di fidanzamento donatole da Arastoo. Alla fine dell'episodio, sulla pista di hockey, Booth salda un vecchio conto con un portiere suo rivale contro il quale aveva giocato al liceo.

• Ascolti USA: telespettatori 3 940 000^[18]

• Titolo originale: The Stiff in the Cliff
• Diretto da: Jeannot Szwarc
• Scritto da: Kathy Reichs & Kerry Reichs

Quando i resti congelati dell'esploratore miliardario Henry Charles vengono rinvenuti in un crepaccio profondo 25 metri nel circolo polare artico, la squadra di Brennan, per via della natura ad alto profilo del caso (di cui parlano anche i telegiornali), viene incaricata di verificare se si sia trattato di omicidio. Le analisi confermano che l'uomo è stato ucciso 15 anni prima, a seguito della sua scomparsa durante una spedizione a cui parteciparono, oltre a lui, solo altre quattro persone, tra le quali l'allora studente Clark Edison, che subito finisce sulla lista dei sospettati. Non potendo lavorare al caso perché coinvolto direttamente, egli viene mandato a casa e al suo posto arriva Wendell. Tutti sono certi che il collega sia innocente e fanno il possibile per provarlo, anche se Clark, su consiglio del proprio avvocato, si rifiuta di condividere informazioni con Booth, e gli indizi sembrano incriminarlo. Alla fine si scopre che l'assassino è una dei partecipanti alla spedizione, la quale aveva danneggiato una scoperta che successivamente Clark aveva tentato di coprire; quest'ultimo ammette a Brennan di essere consapevole di avere comunque sbagliato e la informa che ha intenzione di dare le dimissioni, ringraziandola per aver provato la sua estraneità rispetto all'omicidio, ma lei lo sorprende facendogli leggere un articolo che ha scritto in sua difesa e dicendogli che è nuovamente il benvenuto al Jeffersonian. Da Philadelphia, giunge a Washington la sorella minore di Cam, per aiutarla a organizzare le nozze, ma Cam si rende conto che Felicia ha già pianificato tutto e non le lascia decidere nulla credendo di farle piacere, e per non litigare acconsente alle sue proposte. Alla fine tuttavia Cam trova il coraggio di confessarle che vuole essere lei stessa, essendo la sposa, a decidere l'abito da indossare o la location per il ricevimento, la sorella capisce di avere sbagliato anteponendo i propri desideri ai suoi e si chiariscono.

• Ascolti USA: telespettatori 4 510 000^[19]

• Titolo originale: The Jewel in the Crown
• Diretto da: David Grossman
• Scritto da: Jon Cowan

In un tritavetro viene trovato il corpo di una donna, identificata in una nobile Marchesa francese, con un diamante in bocca; alle indagini partecipa l'Ispettore Rousseau della Police Nationale di Parigi, il quale è convinto che sia stato il marito, e che sia il ladro di gioielli a cui sta dando la caccia da mesi. L'assassino risulterà essere il complice della Marchesa nei furti: era innamorato di lei, ma non ricambiato. Booth inizia ad avere dei problemi di vista e, dopo una visita di controllo, è costretto a usare degli occhiali. Nel laboratorio di Hodgins (che sta continuando la fisioterapia) capitano eventi strani: oggetti e tavolini cadono o si spostano senza che lui riesca a darsi una spiegazione. Mentre lui pensa che si tratti di scosse sismiche, Daisy è convinta che il luogo sia infestato da un fantasma; alla fine lei conduce dei test, concludendo che è stato Hodgins stesso a far cadere inconsciamente gli oggetti, a causa di spasmi muscolari delle gambe, segno che forse sta riacquistando sensibilità.

• Guest star: Sebastian Roché (Ispettore Rousseau)
• Ascolti USA: telespettatori 4 360 000^[20]

• Titolo originale: The Nightmare Within the Nightmare
• Diretto da: David Boreanaz
• Scritto da: Michael Peterson

Il team si immerge nuovamente nell'indagine sul serial killer che si serve delle vittime per creare dei burattini e vive con i loro corpi per molto tempo prima di liberarsene, chiamato appunto "Il Burattinaio", aggiungendo alla lista una donna trovata in un edificio abbandonato che indossa abiti che la Brennan aveva donato e porta i capelli tagliati esattamente come lei: l'assassino l'ha resa somigliante perché è ossessionato dalla Dottoressa, la quale nel frattempo soffre di deprivazione del sonno a causa di spaventosi e vividi incubi in cui viene attaccata da un cadavere gravemente ustionato e il suo tirocinante Wendell ha le mani bruciate. Terrorizzata, in preda ai sensi di colpa per essersi ritirata alla fine dell'anno precedente e dopo aver scoperto che la vittima aveva gli stessi suoi incubi, Bones prenota una seduta dal suo psicologo, il dottor Brandon Faulk, per vedere se sia possibile estrarne qualcosa e se in essi si cela un significato nascosto. Intanto Booth e Aubrey rintracciano un burattinaio nel cui laboratorio sono conservati burattini con le sembianze di tutti i membri della squadra del Jeffersonian; l'assassino non è lui perché in realtà affitta solo la sua cantina al vero killer. Al telefono con Brennan, Angela percepisce che qualcosa non va: infatti Temperance viene rapita dalla Stanza delle Ossa, e Booth, arrabbiato e nel panico, si reca dallo psicologo per farsi dire dove si trova la moglie. Lui non lo sa, ma dà agli agenti i suoi appunti della seduta con Brennan; gli "squints" e Booth riesaminano tutti gli indizi raccolti fino a quel momento e, collegandoli insieme, Booth deduce che il rapitore è nientemeno che Zack Addy (il primo tirocinante protagonista delle prime due stagioni e poi rinchiuso in una clinica psichiatrica). Nell'ultima scena dell'episodio, Brennan si sveglia in una stanza buia, e il volto di Zack appare dall'ombra salutandola e dicendole che hanno molto di cui parlare.

• Ascolti USA: telespettatori 3 740 000^[21]

• Wikiquote contiene citazioni di o su undicesima stagione di Bones

• Sito ufficiale, su fox.com.
• (EN) Episodi di Bones, su Rotten Tomatoes, Fandango Media, LLC.
• (EN) Episodi di Bones, su Metacritic, Red Ventures.
• (EN) Episodi di Bones, su TV.com, Red Ventures (archiviato dall'url originale il 1º gennaio 2012).

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