Nella stagione 1959-1960 il Napoli ha disputato il campionato di Serie A, con 29 punti in classifica ha ottenuto la tredicesima posizione, il titolo di campione d'Italia è andato dalla Juventus che ha vinto il torneo con 55 punti, davanti alla Fiorentina con 47 punti. Sono retrocessi in Serie B il Genoa con 18 punti, l'Alessandria con 25 punti ed il Palermo con 27 punti.
Sotto la guida del nuovo allenatore Annibale Frossi, arrivarono il mediano Gianfelice Schiavone, il secondo portiere Pacifico Cuman e l'attaccante napoletano Gennaro Rambone, nella sua unica stagione in maglia azzurra. Dopo 4 sconfitte nelle prime 4 partite, Annibale Frossi venne esonerato e venne richiamato Amedeo Amadei, che riportò subito la squadra alla vittoria contro l'Atalanta per (1-0). Il 6 dicembre 1959, dopo dieci anni di lavori, è stato inaugurato lo stadio San Paolo con il match contro la Juventus, un incontro di cartello che vide il Napoli imporsi (2-1) con le reti di Vitali e Vinício. L'ultima partita allo Stadio Arturo Collana vide il Napoli imporsi sul Vicenza per (3-1), venne giocata il 15 novembre 1959. Gli azzurri chiusero la stagione al 13º posto con 29 punti, con due punti di vantaggio sulla terzultima, il miglior marcatore stagionale partenopeo è stato il brasiliano Emanuele Del Vecchio con 10 reti in 27 partite.
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