TreeBASE[1] è un deposito di dati filogenetici pubblicati in riviste scientifiche. Negli studi di filogenetica, i dati di ricerca sono raccolti o generati come osservazioni comparative (es.: matrici di stato del carattere o allineamenti multipli in sequenza) create in un insieme di taxa, metadati sui taxa, e gli alberi filogenetici che sono afferenti alla migliore descrizione delle relazioni evolutive tra i taxa.
Il progetto nacque nel 1994[2][3] con un finanziamento della National Science Foundation statunitense. Una riprogettazione ricominciò sotto il progetto CIPRES[4] nel marzo 2010, a cui fu finanziata in aggiunta un'interfaccia web service RESTful con infrastrutture di ricerca CQL[5] e National Evolutionary Synthesis Center (NESCent), che ospita la base di dati e il web server.
Note
[modifica | modifica wikitesto]- ^ TreeBASE, su treebase.org. URL consultato il 5 aprile 2011.
- ^ M. J. Sanderson, M. J. Donoghue, W. Piel e T. Eriksson, TreeBASE: a prototype database of phylogenetic analyses and an interactive tool for browsing the phylogeny of life, in American Journal of Botany, vol. 81, n. 6, 1994, p. 183, DOI:10.2307/2445447.
- ^ W. H. Piel, M. J. Donoghue e M. J. Sanderson, TreeBASE: a database of phylogenetic knowledge, in To the interoperable "Catalog of Life" with partners Species 2000 Asia Oceanea. Research Report from the National Institute for Environmental Studies, n. 171, 2002, pp. 41-47.
- ^ CyberInfrastructure for Phylogenetic Research, su phylo.org. URL consultato il 5 aprile 2011.
- ^ Rutger A. Vos, Hilmar Lapp, William H. Piel e Val Tannen, TreeBASE2: Rise of the Machines, in Nature Precedings, 2010.
Collegamenti esterni
[modifica | modifica wikitesto]- (EN) Sito ufficiale, su treebase.org.
