Le nuove versioni di Paint permettono all'utente di selezionare tre colori contemporaneamente: il primo colore con il tasto sinistro del mouse (colore del tracciato principale), il secondo con il tasto destro (colore di sfondo), e il terzo premendo CTRL e cliccando con il pulsante sinistro o destro del mouse (ma per altri strumenti oltre al tracciato si può usare solo il pulsante sinistro con CTRL). Il sistema di selezione del terzo colore sembra essere presente anche in versioni più vecchie, anche se disattivato o mal sfruttato.

Il programma dispone delle seguenti opzione sul pannello degli strumenti: Selezione parte, selezione, cancella/cancella colore, riempi, scegli colore, ingrandisci, matita, pennello, aerografo, testo, linea, curva, rettangolo, poligono, ellisse e rettangolo arrotondato. Paint non può generare sfumature di colore.

Nel menu immagine si trova: capovolgi/ruota, allunga/inclina, inverti colori, attributi, cancella immagine e opaco.

Il menù colori permette all'utente di modificare i colori (è la sola opzione di questo menu). La finestra di dialogo modifica colori mostra una palette di quarantotto colori predefiniti e sedici spazi per i colori personalizzati. Cliccando su definisci colori personalizzati appare un riquadro con le varie sfumature di colore, selezionabili col cursore del mouse, oppure mediante la definizione di Tinta/Saturazione/Luminosità, oppure con i valori di rosso, verde e blu (RGB).

Questa gamma di colori corrisponde a una variazione di tinta sull'asse orizzontale e a una variazione della saturazione sull'asse verticale. È accompagnata da una barra laterale per il controllo della luminosità. I colori sono di default sono i seguenti: nero, bianco, grigio, grigio chiaro, bordeaux, rosso, verde oliva, giallo, verde scuro, verde, blu-grigio, celeste, blu marino, blu, viola, fucsia, giallo-grigio, giallo paglierino, verde bottiglia, verde pastello, turchese, azzurrino, blu notte, lilla, magenta, marrone e rosa carne. È anche disponibile un'ulteriore gamma di colori.

Paint dispone anche di altre funzioni: per la modalità seleziona, l'utente può selezionare una zona dell'immagine, mantenendo premuto il tasto CTRL, e muovere la selezione su un'altra zona dell'immagine. Questo permette di creare una copia della selezione piuttosto che tagliarla. L'operazione può essere ripetuta tutte le volte necessarie, fino a quando CTRL è mantenuto premuto. La funzione traccia funziona alla stessa maniera, ma si utilizza ⇧ Maiusc invece di CTRL.

L'utente può disegnare delle linee dritte orizzontali, verticali o diagonali con un pennello standard, senza aver lo stesso bisogno della funzione Linee. È sufficiente tenere premuto ⇧ Maiusc e muovere il pennello.

Oltre a ciò è possibile aumentare (CTRL++) o diminuire (CTRL+-) lo spessore della linea mentre viene disegnata. È una tecnica per i meno esperti.