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Davydov-soliton.gif (576 × 425 pixel, dimensione del file: 498 KB, tipo MIME: image/gif, ciclico, 313 frame, 1 min 3 s)
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Dettagli
| Descrizione |
English: Quantum dynamics of a Davydov soliton with pN generated by an initial Gaussian step distribution of amide I energy over 3 peptide groups at the N-end of a single α-helix spine composed of 40 peptide groups (extending along the x-axis) during a period of 125 picoseconds. Quantum probabilities of amide I excitation are plotted in blue along the z-axis. Phonon lattice displacement differences (measured in picometers) are plotted in red along the y-axis. The soliton is formed by self-trapping of the amide I energy by the induced lattice distortion. |
| Data | |
| Fonte |
The file is created using my own mathematical code written for simulation of Davydov soliton |
| Autore | Danko Georgiev |
Licenza
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| 13:42, 24 dic 2018 |  | 576 × 425 (1,79 MB) | Danko Georgiev | {{subst:Upload marker added by en.wp UW}} {{Information |Description = {{en|Quantum dynamics of a Davydov soliton with χ = 35 pN generated by an initial Gaussian step distribution of amide I energy over 3 peptide groups at the N-end of a single α-helix spine composed of 40 peptide groups (extending along the x-axis) during a period of 125 picoseconds. Quantum probabilities |a_n|^2 are plotted in blue along the z-axis. Phonon lattice displacement differences b_n-b_{n-1} (measured in picometers... |
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