Ekberg ha iniziato ad arbitrare all'età di 13 anni. Nel 2001 ha diretto le sue prime partite nei campionati di Division 6 e Division 7. Nel 2004 è diventato arbitro federale (förbundsdomare), mentre nel 2007 ha fatto il suo esordio nel campionato nazionale di Superettan. Quando il 19 luglio 2009 ha debuttato nel massimo campionato svedese, dirigendo la sfida tra Gefle e Helsingborg, è diventato a tutti gli effetti il più giovane arbitro della storia dell'Allsvenskan con i suoi 24 anni, 6 mesi e 17 giorni.[1]. Nel 2013 ha ricevuto il premio di arbitro dell'anno dalla Federcalcio svedese.[2] Sempre nel 2013 è diventato arbitro FIFA. Il 21 maggio 2014 ha diretto la finale degli Europei Under-17 tra Olanda e Inghilterra.[3] Un anno dopo, il 16 luglio 2015, è stato scelto per la semifinale degli Europei Under-19 tra Francia e Spagna.[4]. All'inizio della stagione 2016 aveva all'attivo 112 presenze in Allsvenskan, 56 in Superettan e 36 in campo internazionale.[5]. Selezionato ufficialmente per gli europei under 21 del 2019 in Italia e San Marino.
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